Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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