Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10477F6SW83 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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