Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28374F6SG70 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28374F6SG70 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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