Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9887F6RFI0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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