Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4E9QAP7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms