Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms