Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdzd7E9Q9W7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd7E9Q9W7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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