Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC030500E9Q6W0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms