Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms