Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm3095E9Q058 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms