Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms