Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms