Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms