Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms