Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8994E9PV04 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms