Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms