Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms