Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms