Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms