Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms