Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6133B2RY53 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms