Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah3B2RWG3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Siah3B2RWG3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms