Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2012B1B0R1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2012B1B0R1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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