Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms