Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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