Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms