Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbp4A4UUI3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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