Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prr16A3KMN5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prr16A3KMN5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prr16A3KMN5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prr16A3KMN5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr16A3KMN5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms