Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms