Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palm3A2TJV2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms