Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms