Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms