Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4985A2ALC6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms