Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms