Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprfA2A8L5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprfA2A8L5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprfA2A8L5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprfA2A8L5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtprfA2A8L5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprfA2A8L5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms