Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms