Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms