Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Speer3W4VSP1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Speer3W4VSP1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Speer3W4VSP1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Speer3W4VSP1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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