Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms