Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms