Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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