Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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