Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms