Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cldn7Q9Z261 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn7Q9Z261 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn7Q9Z261 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cldn7Q9Z261 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn7Q9Z261 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn7Q9Z261 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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