Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms