Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms