Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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