Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms