Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms