Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms